財政部訂定各地區國稅局受理包作業營業人因買受人事由無法收回價款申請退還營業稅或留抵應納營業稅作業要點
財政部表示，為配合司法院釋字第688號解釋，建立財政部各地區國稅局受理包作業營業人因買受人事由無法收回價款，申請退還營業稅或留抵應納營業稅案件之一致性處理原則，該部於日前訂定發布「財政部各地區國稅局受理包作業營業人因買受人事由無法收回價款申請退還營業稅或留抵應納營業稅作業要點」，以利徵納雙方依循。
財政部說明，包作業營業人，依加值型及非加值型營業稅法（以下簡稱營業稅法）之營業人開立銷售憑證時限表規定，係採「依其工程合約所載每期應收價款時」之時限開立憑證，該規定依司法院釋字第688號解釋，尚無悖於憲法第7條平等原則及第23條比例原則。惟依該解釋意旨，考量包作業多屬包工兼包料，其作業主要繫於勞務之完成，現行營業稅法規定其開立發票時限（應收價款時）早於勞務承攬業（收款時），但對於開立發票後，營業人無法收取價款情形，未為適當處理，似欠妥適。是以，該部爰參照現行單純買賣業及勞務承攬業開立憑證規定，訂定前開作業要點，明定包作業營業人已繳納但無從轉嫁之營業稅，符合一定要件者，允予退還或留抵應納營業稅，以符衡平。
財政部進一步說明，前開作業要點明定適用行業、條件、得退還或留抵應納營業稅及申請時限等相關規定如下：
1. 適用行業
司法院釋字第688號解釋考量包作業營業人承包工程，其完成之工作物如為不動產，該工作物之所有權原則由定作人取得，包作業營業人不能透過同時履行抗辯權之行使，確保其報酬債權，故本要點適用行業以包作業為限。
2. 適用條件
包作業營業人已依「營業人開立銷售憑證時限表」規定開立統一發票及報繳營業稅者，嗣買受人有下列情事之ㄧ致無法收回價款，得檢附申請書及相關證明文件，就未收回價款之銷項稅額，依該部訂定之計算公式，向主管稽徵機關申請退還已繳納之營業稅或留抵應納營業稅。惟嗣後營業人如有收回前開應收款時，應依法開立統一發票及報繳營業稅。
(1) 買受人倒閉、逃匿、重整、和解或破產之宣告，或其他原因，致應收款之一部或全部不能收回者。
(2) 應收款有逾期2年，經營業人催收後，未能收取者。
3. 准予退還營業稅或留抵應納營業稅之計算
(1) 同一工程已收回價款銷項稅額大於進貨已扣抵進項稅額者：得申請退還營業稅或留抵應納營業稅＝未收回價款之銷項稅額。
(2) 同一工程已收回價款銷項稅額小於進貨已扣抵進項稅額者：得申請退還營業稅或留抵應納營業稅＝未收回價款之銷項稅額－（進貨已扣抵進項稅額－已收回價款銷項稅額）。
4. 申請期限
(1) 買受人倒閉、逃匿、重整、和解或破產之宣告，或其他原因致應收款之一部或全部不能收回者，以事實發生並已取具相關證明文件之翌日起算10年為限。
(2) 應收款有逾期2年，經營業人催收後，未能收取者，以該應收款逾期屆滿2年(原應行償還之翌日起算屆滿2年)之翌日起算10年為限。
財政部最後表示，上開作業要點內容及相關書表，可至財政部賦稅署網站（http://www.dot.gov.tw），點選「便民服務\賦稅法規\行政規則\加值型及非加值型營業稅法相關法規\財政部各地區國稅局受理包作業營業人因買受人事由無法收回價款申請退還營業稅或留抵應納營業稅作業要點」項下查閱。
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